Procedure per determinare la sequenza nucleotidica di un frammento di DNA. Ci sono due metodi comuni per fare questo:

• la tecnica Maxam e Gilbert (degradazione chimica), che utilizza diverse sostanze chimiche per rompere il DNA in frammenti a basi specifiche; o

• la tecnica di Sanger (chiamata il metodo di terminazione di catena o di-deossi) utilizza la polimerasi del DNA per fare nuove catene di DNA, con di-deossi nucleotidi (terminatori di catena) per interrompere la catena in modo casuale come cresce.

In entrambi i casi, i frammenti di DNA sono separati secondo la lunghezza di elettroforesi del gel di poliacrilammide, consentendo la sequenza da leggere direttamente dal gel.