Una sequenza di DNA identificabile che facilita lo studio dell'ereditarietà di un gene o di un tratto. Tali marcatori vengono utilizzati nella mappatura dell'ordine dei geni lungo i cromosomi e in seguito l'ereditarietà dei geni particolari: geni strettamente legate all'indicatore verranno ereditati generalmente con esso. Marcatori devono essere facilmente identificabili nel fenotipo, per esempio controllando una caratteristica facilmente osservabile (come il colore degli occhi) o essendo facilmente rilevabile con mezzi molecolari, per esempio, marcatori microsatelliti (vedi voce). Rilevamento gene di S ee.