La proporzione di gameti che sono sorti dalla ricombinazione tra due loci. Si è stimato come il numero di individui ricombinanti tra un insieme della prole di un accoppiamento particolare, diviso per il numero totale della prole da tale accoppiamento. Rappresentato dalla lettera greca theta (). Collegamento mappe vengono create dalle stime della frazione di ricombinazione tra tutte le combinazioni di coppie di loci.