טכניקה המזהה הדנ א המשוכפל חופפים שברים באותו טופס רציף מיחידה אחת של כרומוזום. קטעים אלה יכול להיווצר על-ידי הטיית אקראית או עיכול חלקי בחותך ארבע-בסיס-זוג כגון סאו 3A. סדרה של המושבה hybridizations ואז מבוצעת, מתחילה עם איזה קטע משובטים אשר כבר זוהתה, אשר ידועה להיות באזור הקיף על ידי שיבוטים חופפים. הזה שבר שזוהה משמש מכשיר בדיקה לבחור שיבוטים המכיל רצפי סמוכים. אלה משמשות לאחר מכן כפי רגשים עצמם לזהות שיבוטים נושאת רצפים הסמוכים להם וכן הלאה. על כל סיבוב של הכלאה אחת "הליכות" נוספות לאורך מחצית הכרומוזום של השבר הראשונית.