האנזים משמש בקרה מזון מרקם, טעם, מראה, במידה מסוימת, ערך תזונתי. Amylases break למטה סוכרים מורכבים כדי סימפלקס סוכרים; פרוטאזות לרכך בשר חלבונים. ביוטכנולוגיה יכול לסייע בפיתוח של אנזימים מזון חדש על ידי מציאת או הנדסה אנזימים אשר מתאים יותר עם האחר תהליכים אשר האוכל חייב לעבור, כמו בישול או שימורים.