טכניקה משתמש יחיד, קצרים (בדרך כלל 10-mer) סינתטי לנוקלאוטידים עבור ה-PCR. הראשיים, רצף של מי נבחר ב אקראית, יוזם שכפול באתרים משלימים שלו על ה-DNA, בהפקת קטעים למעלה עד כ ארוך 2 kb, אשר יכול להיות המופרדים באמצעות אלקטרופורזה, מוכתם אתידיום ברומיד. פריימר יכול להפגין פולימורפיזם בין אנשים, שברי רב שלבית יכולה לשמש סמנים.