סוג II הגבלת endonuclease זה מאגד (ודבק לאחר מכן) DNA באתרים שמכילים רצף של שישה זוגות נוקלאוטיד מזוהה באופן ייחודי על ידי אנזים זה. כי כל רצף בסיסים שישה מתרחש בתדירות נמוכה יותר סיכוי מאשר כל רצף בסיסים ארבע, שש-בסיס חותכני קליב בתדירות נמוכה יותר מאשר ארבע-בסיס חותכני. ובכך, בסיס 6 חותכני ליצור שברים גדולים יותר מאשר ארבע-בסיס חותכני.