אנזים זה במיוחד מדרדרת RNA או דנ א חד גדילי 5´ mononucleotides. Purified מן הפטריה filamentous oryzae אספרגילוס, S ₁ נוקלאז משמש בהערכת מידת הכלאה תגובה על-ידי הסרת אזורים אינטראקצית. הוא משמש גם כדי להסיר את הקצוות דביק של הגבלת קטעים. ב S ₁ מיפוי האזור קידוד של הגן מזוהה על-ידי ביצוע mRNA-DNA הכלאה והסרה אינטראקצית הדנ א עם S ₁ נוקלאז.