נוגדנים יש מבנה מוגדר היטב. כל נוגדן יש שתי שרשראות "אור" זהה, שתי שרשראות "כבדה" זהה. בכל שרשרת כוללת אזור קבוע, קרי, אזור זהה בין נוגדנים באותה הכיתה ו לתתי, אזור משתנה שונה בין. מחייב אנטיגן אזור או איגוד האתר - אזור הקובע משלימים את החסר - הוא האזור משתנה. הנוגדן ניתן לחתוך על ידי פרוטאזות מספר שברים, המכונה חיובי, חיובי ", ו- Fc.