סוג II הגבלת endonuclease זה מאגד (ודבק לאחר מכן) DNA באתרים שמכילים רצף של ארבעה זוגות נוקלאוטיד הוא זיהה באופן ייחודי על ידי אנזים זה. כי כל רצף בסיסים ארבע מתרחשת בתדירות גבוהה יותר סיכוי מאשר כל רצף בסיסים שש, ארבע-בסיס חותכני קליב בתדירות גבוהה יותר מאשר בסיס 6 חותכני. ובכך, ארבע-בסיס חותכני ליצור שברים קטנים יותר מאשר בסיס 6 חותכני.