ההמרה של חנקן אטמוספרי (N ₂) לתוך טפסים מחמצנים יכולים להיטמע על-ידי צמחים. קיבוע חנקן ביולוגית קטליזת על-ידי nitrogenase האנזים, אשר נמצא רק אאוקריוטים. מסוימים אצות כחולות ירוקות, סוגים מסוימים של חיידקים (למשל, spp. ריזוביום; Azotobacter spp.) מסוגלים מבחינה ביוכימית תיקון חנקן. חיידקים כאלה נמצאים סימביונטים חשוב מאוד עבור הצמחים גדל בקרקעות חנקן-העניים.