宿主細胞内で、どの他のDNA配列に自律複製可能な任意のDNA分子が挿入され、したがって、増幅することができる。多くは、プラスミド、バクテリオファージまたはウイルスから派生しています。これらは、レシピエント細胞に外来遺伝子を運ぶために使用されています。遺伝子ベクターは、機能的なレプリケータのサイトを所有し、それらの選択的認識を容易にするための遺伝子マーカーが含まれています。