DNA 断片の塩基配列を決定するための手順。これを行うには、2 つの一般的な方法があります:

• に DNA を破るの異なった化学薬品使用するマクザムとギルバート技術 （化学的な劣化)、フラグメントの特定拠点で; または

• （ディ-デオキシまたはチェーンを終端させるメソッドと呼ばれる） サンガー手法を使用して DNA ポリメラーゼ DNA 鎖の新しいディ-デオキシ ヌクレオチド (ターミネータをチェーン ランダムに成長するにつれて、チェインを停止する) ようにします

。両方のケースでは、DNA のフラグメント長によるとポリアクリルアミドゲル電気泳動ゲルから直接読み取ることには、シーケンスの有効化、区切られています。