具体的には他の分子に結合する機能を悪用することによって分子を分離するためのメソッド。生体親和性クロマトグラフィーのいくつかの種類があります。A 生体分子が動員することができますおよび小さい分子 (ligand、そちらも参照、) にバインドするには、それに立ち往生することができますまたは小さいリガンドを固定化することができ、高分子それに立ち往生。バリアントは固定化分子として抗体を使用してその抗原を「キャプチャ」を使用して： これは免疫アフィニ ティー ・ クロマトグラフィーと呼ばれます。A バリエーションあり擬似アフィニ ティー ・ クロマトグラフィー、生物学的リガンドのような化合物が、固体材料に固定化した酵素または他の蛋白質はそれにバインドします。その他のテクニックを含む金属アフィニ ティー ・ クロマトグラフィー、金属イオンは固体支持体上に固定化した: 金属イオン結合しっかりと具体的に多くの生体分子。金属イオンをキレート剤またはキレート グループ、具体的には、非常に密に結合するその金属化学グループにバインドされます。