タイプ II の制限エンドヌクレアーゼが二本鎖カット内で認識され DNA の特定のヌクレオチド シーケンス。制限のサイトは、通常 4 または 6 回文 (そちらも参照) が通常塩基を構成する

など、5´GGCC3´

3´CCGG5´

2 つの繊維が切ることができるいずれか 1 つの別、鈍端を作成するのに反対またはをずらして付箋を与えて終了すると、関連の酵素によって。