Technika, kuri identifikuoja persidengiančių klonuotų DNR fragmentai tos formos vienas nuolat segmentas, chromosomos. Šie fragmentai gali būti generuojami atsitiktinai kirpimo arba dalinio skaidymo produktas gaunamas naudojant keturių-base-pora pjovimo pvz Sau 3A. Nemažai kolonija hybridizations tada atliekamas, pradedant nuo kai kurių klonuotų fragmentas, jau buvo nustatyta ir, žinoma, kad apima persidengiančių klonų regione. Šis nustatytas fragmentas atliekamas kaip zondą išskirti klonai su gretimų sekas. Jie tada naudojami kaip zondai patys nustatyti klonai vykdymo sekų šalia jų ir taip toliau. Kiekvieno turo hibridizacijos, vienas "pasivaikščiojimais" toliau chromosoma nuo pradinio fragmento.