VNTR (skat) form. Konkrēti, DNS, kas raksturo mainīgs skaits (no dažiem līdz 30 vai tik) kopijas secība ap 5 vai mazāk bāzes gadījumu segments (sauc par atkārtošanas intervālu, skat). A tipisks microsatellite ir atkārtošanās intervālu AC, kas notiek aptuveni 100 000 dažādās vietās tipisks zīdītāju genomu. Jebkurā vienā vietā (locus), parasti ir vairākas dažādas "alēles," katrs identificējami saskaņā ar numuru atkārtošanas vienību. PCR (skat.), izmantojot praimerus no unikāls sērijas, kas atrodas abās pusēs microsatellite izstrādāta, iespējams noteikt šiem alēles. Ja PCR produkts tiek palaists klājamās želeja, alēles tiek uztverti atšķirīga garuma vienībās vienāda lieluma atkārtošanas intervālu, piemēram, ja praimeri atbilst unikālo secību tūlīt abās pusēs microsatellite un katra 20 bāzes ilgi, un indivīds ir heterozygous AC microsatellite ar vienu alēles, ko veido 5 atkārto un otru, ko veido 6 atkārto, heterozygote izstādes divām joslām želeja, viena grupa ir 20 + (2 × 5) + 20 = 50 bāzes gara un citi alēles, ir 20 + (2 × 6) + 20 = 52 bāzēm garu. Microsatellites bijuši standarta DNS marķieri: tie ir viegli nosakāms ar PCR, un tie mēdz būt vienmērīgi izvietotas visā genomā. Tūkstošiem kartētu daudzu dažādu sugu.