DNS, kas ir atzīta tipa II ierobežojumu endonukleāzes un kas to padara balasta dubultā grieztiem īpašu nukleotīdu secību. Ierobežošanas vietām parasti veido četras vai sešas bāzu pāru, kas parasti ir palindromic (skat), piem., 5´GGCC3´

3´CCGG5´

divi virzieni var sagriezt vai nu pretī viens otru, lai veidotu neass galiem, vai sadala veidā, dodot lapiņas beidzas, atkarībā no iesaistīto fermentu.