Reakcijas apstākļi - proti, temperatūru, sāls atšķirtos un pH-, kas diktētu atkvēlināšanas no vienas-balasta DNS/RNS DNS/DNS un RNS/RNS hibrīdi. Pie augsta stingrība, duplexes veido tikai starp jomām ar perfektu divpusēju savstarpēju papildināmību; zemāks stingrības ļauj atkvēlināšanas starp jomām ar zināmu nesakritību starp bāzes.