Vakcīnas sastāvā dzīvo vīrusu, nevis miris tiem vai atdalot daļu no vīrusiem. Tomēr kā vīruss, pati par sevi nevar izmantot, jo tas vienkārši dotu pacienta slimības, vīruss ir gēnu inženierijas tāpēc, ka izvilina imūnsistēmas reakciju uz patogēnu vīrusu slimība pati par sevi neradot.

Divas gēnu inženierijas metodes var izmantot. Pirmais ir panākt slimības vīrusa nekaitīgs, bet joprojām spēj reproducēt dzīvnieku šūnu kultūrās. Tas ir līdzīgs ražo "novājinātas" vīrusu, t.i., tāds, kas izaugusi laboratorijā, kamēr tas zaudē savu spēju izraisīt slimību. Tomēr ģenētiskās inženierijas maršruta mērķis ir pārliecināties, ka novājinātu vīrusu ir izredžu mutējošais atpakaļ uz savvaļas tipa, patogēnu vīrusu, izdzēšot visu gēnu vai aizstājot galvenie gēni reģionos ar pavisam citu ģenētisko materiālu.

Otrā pieeja ir klons olbaltumvielas no patogēnu vīrusu gēnu uz citu, nekaitīgs vīruss, tā, lai rezultāts izskatās, piemēram, patogēnu vīrusu, bet neizraisa slimību.