Bacteriën, schimmels of algen micro-organisme per ongeluk geïntroduceerd in een cultuur of kweekmedium. Verontreiniging kan overwoekeren de plantencellen en bijgevolg hun groei te remmen. Werken onder aseptische condities met een rigoureuze uitsluiting van potentiële verontreinigingen moet worden beoefend in weefselkweek.