Een set van drie nulecotides waarvoor er is geen overeenkomstige tRNA molecuul een aminozuur invoegen in de polypeptide ketting. Eiwit synthese vandaar is beëindigd en de voltooide polypeptide vrijgegeven van het ribosoom. Drie stop codonen zijn gevonden: UAA (oker), TECOS (amber) en UGA (opal). Mutaties die genereren een van deze drie codonen in een positie die normaal bevat een codon waarin een aminozuur staan bekend als onzin mutaties. Stop codonen kunnen ook onzin codonen worden genoemd.