Een techniek met behulp van enkele, korte (gewoonlijk 10-mer) synthetische oligonucleotide inleidingen voor PCR. De primer, waarvan volgorde is willekeurig gekozen, initieert replication op zijn aanvullende sites op de fragmenten van DNA, produceren tot ongeveer 2 kb lang, die kan worden gescheiden door elektroforese en gekleurd met ethidiumbromide. Een primer kan vertonen polymorfisme tussen individuen, en polymorfe fragmenten kunnen worden gebruikt als markeringen.