Afvalwaterbehandeling is een van de meest voorkomende biotechnologische processen in westerse samenlevingen, om te gaan met de enorme hoeveelheid menselijk en dierlijk afval die dergelijke samenlevingen produceren. Afvalwater behandelingsmethoden lopen sterk uiteen, maar hebben allemaal een biologische basis te breken het organisch materiaal in afvalwater en omzetten in iets dat veilig kan worden geloosd in het milieu (meestal rivieren of zeeën).