Een type II restrictie endonuclease die op sites die bevatten een reeks van zes nucleotide paren die uniek wordt herkend door dat enzym DNA bindt (en vervolgens cleaves). Omdat een reeks van zes honken minder vaak bij toeval dan een reeks van vier bases plaatsvindt, zes-base scharen klieven minder vaak dan vier-base scharen. Dus , zes-base scharen maken grotere fragmenten dan vier-base scharen.