En genetisk teknikk som brukes til å erstatte én kopi av et gen eller andre DNA sekvensen innen et genom, med et endret kopi av den sekvensen. The DNA er først klonet og deretter endret på noen måte, f.eks en transposon settes inn i et gen. Den muterte genet kopi kan brukes til å erstatte den opprinnelige genet av rekombinasjon i vivo. Inkorporering av den muterte genet er vanligvis valgt, for eksempel i kraft av sin inneholder en transposon-kodet antibiotikaresistens.