En klasse av enzymer som fornedre DNA eller RNA molekyler av cleaving phospho-diester obligasjoner som kobler tilstøtende nukleotider. i deoxyribonuclease (DNase), underlaget er DNA. i endonuclease, den innstiftet på interne steder i underlaget molekylet. Exonuclease innstiftet gradvis fra slutten av underlaget molekylet. i ribonuclease (RNase), underlaget er RNA. I S1 nuclease, underlaget er enkelt-strandet DNA eller RNA. Nucleases har varierende grad av base-sekvens spesifisitet, de spesifikke som begrensning endonucleases.