Uma técnica que identifica o DNA clonado sobreposição de fragmentos que forma um contínuo segmento de um cromossomo. Estes fragmentos podem ser gerados por distorção aleatória ou por digestão parcial com um cortador de quatro pares-base como Sau 3A. Uma série de colônia hibridação é então realizada, começando com algum fragmento clonado que já foi identificado e que é conhecido por ser na região englobada por clones sobrepostos. Este fragmento identificado é usado como uma sonda para escolher clones contendo sequências adjacentes. São usados como sondas se identificar clones carregando sequências adjacentes a eles e assim por diante. a cada rodada de hibridização um "passeios" ainda mais ao longo do cromossoma do fragmento inicial.