Uma enzima que digere o DNA ou RNA, começando nas extremidades dos fios. Requer uma extremidade livre para degradar a uma molécula de DNA ou RNA. 5´ se exonucleases exigem uma extremidade livre 5´ e degradam a molécula no 5´ de direção 3´. 3´ se exonucleases exigem uma extremidade livre 3´ e degradam a molécula na direção oposta.