Komensalnych bakterii zamieszkujących jelita grubego wielu gatunków. E. coli jest powszechnie stosowany w biologii, jako prosty model biochemicznych funkcji komórek i hosta dla molekularnej eksperymentów klonowania. Badania środowiska, jest kluczowym wskaźnikiem zanieczyszczenia wody ze względu na ludzką ilości ścieków.