Enzym, który rozkłada specjalnie RNA lub jednoniciowego DNA do 5´ mononukleotydów. Oczyszczona z nitkowatych grzyba Aspergillus oryzae, S ₁ nukleazy jest używany w ocenie w zakresie reakcji hybrydyzacji usuwając nieparzysty regionów. Jest również stosowany do usunąć lepki kończy się fragmentów ograniczenie. W S ₁ mapowanie, regionie kodowania genów jest wykrywany przez wykonywanie hybrydyzacji mRNA DNA i usuwanie nieparzysty DNA z S ₁ nukleazy.