Sekwencja aminokwasów, która została zaprojektowana do białka, aby ułatwić jej oczyszczania. Te mogą pracować w różny sposób. Tag może być innego białka, które łączy do innych materiałów, bardzo mocno i w ten sposób pozwalając białka aby zostać oczyszczone za pomocą chromatografii powinowactwa (połączone). Tag może być sekwencję Krótki aminokwas, który jest rozpoznawany przez przeciwciało. Zważywszy, że to nie zrobiłby tak przed przeciwciał następnie wiązać do białka. , Taki krótki peptydu, o nazwie flaga, został zaprojektowany tak, że jest to szczególnie łatwe do wytwarzania przeciwciał przeciwko niemu. Tag może być kilka aminokwasów, które są następnie wykorzystywane jako znacznik chemicznych na białko. Na przykład, ciąg dodatnio naładowane aminokwasy będzie bardzo silnie wiązać się ujemnie naładowany filtr: to może być stosowane jako podstawa systemu separacji. Niektóre aminokwasy wiążą metale bardzo mocno, zwłaszcza w parach: Ta właściwość chemiczna może być wykorzystana przy użyciu filtru z atomów metalu chemicznie związane na to wyciągnąć białko z mieszaniny białek.