Bakteryjne, grzybicze lub glonów organizmu mikro przypadkowo wprowadził do kultury lub pożywki. Zanieczyszczeń może zarastają komórek roślinnych i w konsekwencji hamuje ich wzrost. Pracy w warunkach aseptycznych rygorystyczne wykluczeniem potencjalnych zanieczyszczeń musi być praktykowana w hodowli tkankowych roślin.