Metoda analityczna do oddzielania cząsteczek od ich wielkości. Próbki są umieszczane na końcu płyty żel polimerowy; pola elektrycznego w żelu ściąga cząsteczek; mniejsze cząsteczki łatwiej przekazać i tak poruszają się w kierunku drugiego końca szybciej różnej wielkości cząsteczek kończy się w różnych pozycjach według ich wielkości. Żele są wykonane z różnych materiałów.

Różnych substancji chemicznych może być zawarty w żelu do pomocy separacji, takie jak siarczan dodecylo detergentu sodu (SDS) w białko żele rozwijać białka lub mocznika w żele sekwencjonowania DNA, który rozwija się DNA.