Uma técnica que identifica o DNA clonado sobreposição de fragmentos que forma um contínuo segmento de um cromossomo. Estes fragmentos podem ser gerados por distorção aleatória ou por digestão parcial com um cortador de quatro-base-par como Sau 3A. Uma série de colônia hibridação é então realizada, começando com algum fragmento clonado que já foi identificado e que é conhecido por ser na região englobada por clones sobrepostos. Este fragmento identificado é usado como uma sonda para escolher clones contendo sequências adjacentes. São usados como sondas se identificar clones carregando sequências adjacentes a eles e assim por diante. a cada rodada de hibridização um "passeios" ainda mais ao longo do cromossoma do fragmento inicial.