Em relação a quaisquer dois loci, a ocorrência de haplótipos (gâmetas), com uma freqüência igual ao produto da freqüência dos dois alelos relevantes, por exemplo, loci A e B está em equilíbrio de ligação se a frequência do haplótipo (gameta) A _I B _i é igual ao produto das freqüências dos alelos A _i e B _i. aka enlace equilíbrio, mas isso é um termo enganoso, pois o conceito aplica-se igualmente aos loci vinculados e não vinculados.