Um segmento de duplex DNA, cuja seqüência de 5´-de-3´ é idêntica em cada DNA strand. a seqüência é a mesma quando um fio é ler a esquerda para a direita e a outra vertente é ler direito para a esquerda. Normalmente, sites de reconhecimento para endonucleases de restrição do tipo II são palíndromos.