Tratamento de esgoto é um dos processos biotecnológicos mais difundidos nas sociedades ocidentais, para lidar com as enormes quantidades de resíduos humanos e animais que produzem tais sociedades. Métodos de tratamento de esgoto de variam muito, mas todos têm uma base biológica para quebrar o material orgânico no esgoto e convertê-lo em algo que pode ser descarregada com segurança no ambiente (geralmente em rios ou mares).