O schemă de clasificare indicând plasmide care pot co-exista într-o singură celulă. Plasmidele trebuie să aparţin grupuri incompatibilitatea diferite să coexiste în aceeaşi celulă. Plasmide care aparţin aceluiaşi grup de incompatibilitate sunt instabile atunci când sunt plasate în aceeaşi celulă. A plasmidă vector de clonare întotdeauna ar trebui să aparţin unui grup de incompatibilitate diferă de bacterie gazdă endogene plasmide.