Un termen folosit pentru a descrie orice proces sau enzimă care acţionează la o secvenţă definite în termen de o moleculă de ADN sau ARN-ului. Enzime de restricţie de tip II se sitului endonucleaza şi recombinare sisteme codificate de unele transposons sunt specifică, cum ar fi este integrarea fage în E. coli cromozomiale.