O enzimă care digera ADN sau ARN-ului, începând de la capetele de toroane. Necesită un end gratuit pentru a degrada o molecula de ADN sau ARN-ului. 5´ exonucleases necesită un capăt de drum liber 5´ şi degrada molecula în 5´ pentru 3´ direcţie. 3´ exonucleases necesită un capăt de drum liber 3´ şi degradează molecula în direcţia opusă.