Epurare a apelor este unul dintre cele mai raspandite procese biotehnologice în societăţile occidentale, să se ocupe cu sume imense de deşeuri umane şi animale, care produc aceste societăţi. Metodele de tratament canalizare variază considerabil, dar toate au o bază biologice pentru a rupe în jos de materii organice în canalizare şi de ao transforma în ceva care poate fi în condiţii de siguranţă este descărcată în mediu (de obicei, râuri sau mări).