Систематическое название и номер, позволяющий идентифицировать фермент в технической литературе. Назначенный Комиссией фермента, номер ЕС состоит из четырех чисел, разделенных точками: первая классифицирует фермента в один из шести широких групп: 1. Оксидоредуктазы; 2. трансферазы; 3. гидролазы; 4. ЛиАЗ; 5. isomerases; 6. ligases. Каждой группы подразделяется на подгруппы, каждая подгруппа в sub-sub-groups и последний номер специфичен для фермента, например, ЕС 3.1.21.1 является дезоксирибонуклеаза я.