Одноцепочечной ДНК или РНК фрагмент используется в генной инженерии для поиска конкретного гена или другие последовательности ДНК. Зонд имеет базовый дополнение к последовательности целевого объекта последовательности и таким образом будет прикрепить к ней на basepairing. Путем маркировки зонд, он может быть идентифицирован после последующего разделения и очистки.