Последовательность ДНК найдены в нескольких генов, которые участвуют в спецификации органов в различных частей тела в животных; они характерны генов, которые влияют на сегментации в животных. Гомеобокс соответствует аминокислотной последовательности в полипептид, закодированные эти гены; эта последовательность называется гомеодомен.