Technika, ktorá identifikuje prekrývajúce klonovaných DNA fragmentov formu jedného kontinuálneho segmentu chromozómu. Týchto úlomkov môžu byť generované náhodné strihanie alebo čiastočným rozkladom s štyri-base-pair rezačkou ako Sau 3A. Rad kolónie hybridizations potom vykonáva, počnúc niektoré klonovaných fragment ktoré už boli identifikované a ktorá je známa v oblasti zahrnuté v prekrývajúcich klony. Tento identifikované fragment sa používa ako sonda vybrať klony obsahujúce priľahlých sekvencií. Potom používajú ako sondy sami určiť klony prepravujúce sekvencie priľahlých k nim a tak ďalej. v každom kole hybridizácia, jeden "prechádzky" ďalej pozdĺž chromozóm od počiatočnej fragment.