Metóda sekvencovania dlho (> 1 kb) klonovaných kusy DNA. Pôvodnej postupnosti reakcie ukazuje poradie prvých niekoľko sto nukleotidov klonovaných DNA. Na základe týchto údajov, základný náter s obsahom o 20 nukleotidov a komplementárne sekvencie ku koncu zameraných DNA syntetizuje a je potom použitý pre budúci niekoľko stoviek nukleotidov klonovaných DNA sekvenovania. Tento postup sa opakuje, kým je určená úplná Nukleotidová sekvencia klonovaných DNA.