Podiel gamét, ktoré sa objavili od rekombinácie medzi dvoma loci. Sa odhaduje ako počet rekombinantný jednotlivcov v množine potomkov najmä párenie, deleno počet potomkov z tohto párenia. Predstavujú podľa gréckeho písmena theta (). Prepojenie mapy sú vytvorené z odhadov rekombinácie frakcie medzi všetky pair-múdry kombinácie lokusov.