Splošni izraz za vse stvari, ki se dogajajo v biotehnološkim postopkom po biologija, se je vrenje mikroorganizem ali rast rastlin. Je še posebej pomembna za fermentacijo procesov, ki proizvajajo veliko količino razredčene zmesi snovi, izdelkov in mikroorganizmov. To morate ločiti, in izdelek mora biti koncentrirana prečiščena in pretvori v obliko, ki je koristen.