Spojina, ki ubija organizmov na podlagi posebnih bioloških učinkov in ne kot širše kemičnih strup. Posebne vrste vključujejo bio-insekticidov in bio-fungicidi. Bio-pesticidi razlikujejo od dejavnikov biološkega nadzora, bio-pesticidi so pasivni agenti, ker dejavnikov biološkega nadzora so aktivni, iskanju škodljivcev, da je treba uničiti. Obstaja nekaj izjemno privlačna anti-škodljivcev materialov, kot so toksin Bacillus thuringiensis (Bt), ki posebej moti absorpcijo hrane iz drobovja nekatere žuželke, vendar je neškodljiva za sesalce. Razloge za razvoj bio-pesticidov je, da so bolj verjetno, da je biološko razgradljiva in so usmerjene na posebne elemente za zatiranje presnovo.